药物-靶蛋白结合位点分析
产品名称: 药物-靶蛋白结合位点分析
英文名称: HDX-DrugSite
产品编号: ZK102
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更新时间: 2026-02-03T10:53:53
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新一代氢氘交换质谱与分子计算模拟集成的药靶互作结构解析系统 本产品通过将氢氘交换质谱(HDX-MS)的实验观测能力与分子模拟的计算阐释能力深度融合,实现了从“定位结合区域”到“解析结合机制”的跨越,为药物发现提供动态、精确的决策依据。 核心在于建立 “实验数据驱动计算,计算结果反馈验证”的闭环工作流。 技术路线: 01. HDX生成动态口袋 快速检测药物结合引起的蛋白质构象变化与动态性差异,精确到肽段水平。 02. 数据引导的分子对接 以上述动态口袋为约束条件,指导药物分子对接,确保模拟起点更贴近真实生物状态。 03. 增强分子动力学模拟 在HDX提示的关键变化区域进行强化采样,高效获取高精度结合姿态与动态轨迹。 04. 整合分析与机制提取 交叉比对模拟轨迹的原子相互作用与HDX动力学数据,提取结合关键残基、作用力网络及变构路径。 整合互补技术 实现优势倍增 HDX-MS实验
技术模块
核心贡献
整合优势
提供真实的、全局的蛋白质动态变化数据,灵敏度高,无分子尺寸限制。
为模拟提供“地面实况”锚点,大幅缩小计算搜索空间,确保模拟的生物学相关性,克服单纯模拟的起始偏差问题。
分子模拟计算
提供原子分辨率的、时序连续的三维结构动态与能量景观信息。
将HDX信号转化为机制见解,精确指认关键残基、可视化变构信号通路、量化相互作用贡献,克服HDX分辨率不足的限制。
